Bonjour Christelle
Quelle est la taille exacte de chacun des fichiers ?
Comme indiqué dans ce post Upload fichiers RStudio server , similaire à votre problème, vous pouvez transférer vos données sur le serveur core.cluster.france-bioinformatique.fr (via un client SFTP tel que FileZila ou autre). En effet , les "home directories" sont partagés entre toutes les machines du cluster et le serveur rstudio.
Pour transférer, quelques infos complémentaire ici: https://ifb-elixirfr.gitlab.io/cluster/doc/data/
Merci Nicole