Problème PROKKA

Galaxy
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Bonjour,
Merci pour l'installation de PROKKA car je voulais aussi le tester.
Je rencontre néanmoins une erreur lors du lancement de l'outil, il semblerait que l'exécutable tbl2asn soit trop ancien:

[tbl2asn] This copy of tbl2asn is more than a year old. Please download the current version.
[11:59:06] Could not run command: tbl2asn -V b -a r10k -l paired-ends -M n -N 1 -y 'Annotated using prokka 1.13.7 from https://github.com/tseemann/prokka' -Z outdir/prokka.err -i outdir/prokka.fsa 2> /dev/null

Pourriez-vous regarder SVP?
Merci

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@Alba
Il semble en effet y avoir un soucis avec tbl2asn : https://github.com/tseemann/prokka/issues/511

Est-ce que tu utilises bien la dernière version
module load prokka/1.14.6

Je vois une référence à Annotated using prokka 1.13.7 dans la sortie d'erreur !?

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Bonjour,

En effet il semblerait que ce soit Prokka 1.13.7 qui soit utilisée; précision importante que j'ai oublié de mentionner, j'utilise Prokka via usegalaxy.fr, je n'ai donc pas le choix de la version.
J'ai fait le raccourci un peu rapide qu'il y avait un lien entre l'installation que tu viens de faire et l'outil dispo sous Galaxy, je viens de voir qu'il y avait une catégorie du forum dédiée, peut-être peux-tu y déplacer mon problème?

Merci

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Done

Il y a une nouvelle version du wrapper Prokka pour Galaxy : 1.14.5+galaxy0.
Nous allons l'installer

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Entendu, merci, je testerai à nouveau après et ferai un retour.

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La dernière version de prokka est disponible sur usegalaxy.fr :
**Prokka** Prokaryotic genome annotation (Galaxy Version 1.14.5+galaxy0)

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Bonjour,

Merci beaucoup; j'ai relancé le traitement sur mon génome bactérien avec la dernière version de l'outil, tout semble s'être bien passé.

Bonne fin de journée

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